ISPD/CRPPA 基因相关文献库

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序号 发表日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 突变信息 数据类型 样本量
1 2023-Aug-21
Noncoding genetic variation in ISPD distinguishes gamecocks from nongame chickens
2023-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 通过对全球多样化斗鸡(gamecock)和非斗鸡基因组进行测序与比较,鉴定出ISPD基因内含子中一个极端分化的非编码变异,揭示斗鸡的共同起源及其与非斗鸡的遗传区别 构建了迄今最多样化的鸡基因组数据集(307个样本),首次发现ISPD基因内含子变异是区分斗鸡与非斗鸡的最强选择信号位点,且该变异在斗鸡中频率高达90%,在非斗鸡中仅为4% 仅基于基因组测序数据,未对ISPD内含子变异的功能机制及其如何影响攻击性/战斗表现进行实验验证 揭示全球斗鸡的遗传关系、共同起源,以及与非斗鸡在基因组层面的区别,并鉴定与战斗表现相关的关键基因位点 全球地理多样化斗鸡(44只)及多品种非斗鸡(62只),结合已发表基因组共307个鸡样本 genetics NA 全基因组测序(whole-genome sequencing)、群体遗传学分析、选择信号检测 ISPD基因内含子中的一个非编码变异(具体核苷酸变化未在摘要中提供),在斗鸡中频率约90%,在非斗鸡中频率约4%;该变异为群体水平的多态性位点,与鸡的攻击性/战斗表现相关,非疾病致病变异 基因组(whole-genome sequencing数据) 共307只鸡,其中本研究新测序44只斗鸡和62只非斗鸡,其余为已发表的公开基因组数据
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